Mallar Chakravarty, PhD
Contact
mallar@cobralab.ca
6875 Boulevard LaSalle
Montréal, QC
H4H 1R3
Bureau:GH-2112, Cerebral Imaging Centre
Site web du laboratoire:http://www.cobralab.ca/
Directeur, Centre d’imagerie cérébrale, Centre de recherche Douglas
Chercheur, Centre de recherche Douglas
Spécialiste en neurosciences computationnelles, Centre d’imagerie cérébrale, Centre de recherche Douglas
Professeur agrégé, Département de psychiatrie, Université McGill
Membre associé, Département de génie biomédical, Université McGill
Chercheur-boursier, Fonds de recherche du Québec – Santé (FRQS), Junior 2
Nom du laboratoire: Anatomie computationnelle du cerveau
Groupe thématique: Santé mentale des jeunes et intervention précoceDivision: Neuroscience humaine
Le Laboratoire CoBrA (Computational Brain Anatomy Laboratory) est situé dans la Centre d’imagerie cérébrale de l’Institut Douglas. L’équipe constitue un laboratoire multidisciplinaire dynamique qui s’intéresse à l’anatomie du cerveau, et qui étudie plus particulièrement : comment le cerveau évolue durant l’adolescence, comment le cerveau reste en bonne santé durant le processus normal de vieillissement, comment les altérations dans l’anatomie du cerveau sont reliées aux maladies neurodégénératives telles que l’Alzheimer et le Parkinson, et aux troubles neurologiques du développement tels que la schizophrénie.
Pour ce faire, le CoBrA Lab utilise et élabore des techniques neuroanatomiques par ordinateur capables de décrypter la complexité géométrique de l’anatomie du cerveau.
Les membres du groupe de recherche sont issus de domaines divers et sont notamment des neuroscientifiques, des informaticiens, des ingénieurs et des physiciens. Ils ont tous comme objectif d’améliorer la compréhension des relations entre les structures et les fonctions du cerveau, aussi bien chez les sujets en bonne santé que chez les sujets malades.
Le groupe rend accessible au public une grande partie de leurs travaux sur les algorithmes et sur l’atlas du cerveau dans le but de promouvoir une science ouverte et reproductible.
Mallar Chakravarty, Ph. D., détient un baccalauréat en génie électrique de l’Université de Waterloo et un doctorat en génie biomédical de l’Université McGill. Il a par la suite obtenu des bourses de recherche postdoctorales à Aarhus, au Danemark – puis conjointement – à l’Institut de recherche Rotman et au Mouse Imaging Centre (MICe) de l’Hôpital des enfants malades de Toronto, au Canada. Entre ses postdoctorats, le Dr Chakravarty a travaillé à l’Institut de neurosciences Allen (Institute for Brain Science) à Seattle, dans l’État de Washington, aux États-Unis.
1. Fonds de Recherche Santé Québec – Young Investigator Award Junior 1
2. Sertuener Award for best scientific work in pain research in Germany (for work in Sprenger et al. Brain 2012; senior author)
Daniel Gallino
Gabriel A. Devenyi, Ph.D.
Jake Shenker
Jane Su
Julie Winterburn
Matt Park
Nikhil Bhagwat
Raihaan Patel
Roberto S.C. Amaral
Saashi Bedford
Alyssa Salaciak
Stefanie Kübel
Vincent Kong
Vivian Lynn
1. Aristotle N. Voineskos*, Julie Winterburn*, Daniel Felsky, Jon Pipitone, Tarek K. Rajji, Benoit H. Mulsant, M. Mallar Chakravarty. Hippocampal (subfield) volume and shape in relation to cognitive performance across the adult lifespan. Human Brain Mapping, in press.
2. M. Mallar Chakravarty, Judith L. Rapoport, Jay N. Giedd, Armin Raznahan, Philip Shaw, D. Louis Collins, Jason P. Lerch*, and Nitin Gogtay*. Striatal shape abnormalities as a novel neurodevelopmental endophenotype in schizophrenia: a longitudinal study. Human Brain Mapping, 36(4):1458-1469, 2015.
3. Jon Pipitone, Min Tae Park, Julie L. Winterburn, Tristram A. Lett, Jason P. Lerch, Jens C. Pruessner, Martin Lepage, Aristotle N. Voineskos, M. Mallar Chakravarty and the Alzheimer’s Disease NeuroImaging Initiative. Multi-atlas segmentation of the whole hippocampus and subfields using multiple automatically generated templates. NeuroImage, 101(1 November):494-512, 2014.
4. Amy C. Janes, Min Tae Park, Stacey Farmer, and M. Mallar Chakravarty. Striatal morphology is associated with tobacco cigarette craving. Neuropsychopharmacology, 40(2): 406-411, 2015.
5. Philip Shaw, Pietro De Rossi, Bethany Watson, Amy Wharton, Deanna Greenstein, Armin Raznahan, Wendy Sharp, Jason P. Lerch, and M. Mallar Chakravarty. Mapping the development of the basal ganglia in children with Attention-Deficit/ Hyperactivity Disorder. Journal of the American Academy of Child and Adolescent Psychiatry, 53(7):780—9, 2014.
6. Min Tae M. Park, Jon Pipitone, Larry Baer, Julie L. Winterburn, Yashvi Shah, Sofia Chavez, Mark M. Schira, Nancy J. Lobaugh, Jason P. Lerch, Aristotle N. Voineskos, and M. Mallar Chakravarty. Derivation of high-resolution MRI atlases of the human cerebellum at 3T and segmentation using multiple automatically generated templates NeuroImage, 95(15 July 2014):217-231, 2014.
7. Armin Raznahan, Philip W. Shaw, Jason P. Lerch, Liv Clasen, Dede Greenstein, Rebecca Berman, Jon Pipitone, M. Mallar Chakravarty*, and Jay N. Giedd*. Longitudinal four-dimensional mapping of subcortical anatomy in human development. Proceedings of the National Academy of Sciences (PNAS), 111(4):1592—7, 2014.
8. Julie L. Winterburn, Jens Pruessner, Sofia Chavez, Mark Schira, Nancy J. Lobaugh, Aristotle N. Voineskos, and M. Mallar Chakravarty. A novel in vivo atlas of the human hippocampal subfields using high-resolution 3T magnetic resonance imaging. NeuroImage. 74(1 July 2013):254—65, 2013.
9. M. Mallar Chakravarty, Patrick Steadman, Matthijs C. van Eede, Rebecca D. Calcott, Victoria Gu, Philip Shaw, Armin Raznahan, D. Louis Collins, and Jason P. Lerch. Performing label-fusion based segmentation using multiple automatically generated templates. Human Brain Mapping, 34(10):2635—54, 2013.
10. Till Sprenger, Christian L. Seifert, Michael Valet, Anna P. Andreou, Annette Foerschler, Claus Zimmer, D. Louis Collins, Peter J. Goadsby, Thomas R. Tölle, and M. Mallar Chakravarty. Assessing the risk of thalamic pain by MRI lesion mapping. Brain. 135(Pt 8): 2536—45, 2012.
11. Michael J. Hawrylycz, Ed S. Lein, Angela L. Guillozet-Bongaarts, Elaine H. Shen, Lydia Ng, Jeremy A. Miller, Louie N. van de Lagemaat, Kimberly A. Smith, Amanda Ebbert, Zackery L. Riley, Chris Abajian, Christian F. Beckmann, Amy Bernard, Darren Bertagnolli, Andrew F. Boe, Preston M. Cartagena, M. Mallar Chakravarty, Mike Chapin, Jimmy Chong, Rachel A. Dalley, Barry David Daly, Chinh Dang, Suvro Datta, Nick Dee, Tim A. Dolbeare, Vance Faber, David Feng, David R Fowler, Jeff Goldy, Benjamin W. Gregor, Zeb Haradon, David R. Haynor, John G. Hohmann, Steve Horvath, Robert E. Howard, Andreas Jeromin, Jayson M. Jochim, Marty Kinnunen, Christopher Lau, Evan T. Lazarz, Changkyu Lee, Tracy A. Lemon, Ling Li, Yang Li, John A. Morris, Caroline C. Overly, Patrick D. Parker, Sheana E. Parry, Melissa Reding, Joshua J. Royall, Jay Schulkin, Pedro Adolfo Sequeira, Clifford R. Slaughterbeck, Simon C. Smith, Andy J. Sodt, Susan M. Sunkin, Beryl E. Swanson, Marquis P. Vawter, Derric Williams, Paul Wohnoutka, H. Ronald Zielke, Daniel H. Geschwind, Patrick R. Hof, Stephen M. Smith, Christof Koch, Seth G.N. Grant, Allan R. Jones. An Anatomically Comprehensive Atlas of the Adult Human Brain Transcriptome. Nature. 489 (7416): 391-9, 2012.
12. M. Mallar Chakravarty, Daniel Felsky, Maria Tampakeras, Jason P. Lerch, Benoit H. Mulsant, James L. Kennedy, and Aristotle N. Voineskos. DISC1 and striatal volume: a potential risk phenotype for mental illness. Frontiers in Neuropsychiatric Imaging and Stimulation. 3(57): 10.3389/fpsyt.2012.00057, 2012.